Qua phản ánh của báo chí về hiện tượng bán hàng không xuất hóa đơn chưa được các cơ quan xử lý triệt để và tình trạng bán hàng không xuất hóa đơn ở các doanh nghiệp vừa và nhỏ, siêu thị, nhà hàng, các hộ kinh doanh… vẫn còn diễn ra với nhiều hình thức tinh vi nhằm mục đích trốn thuế, ngày 27-4-2011, Tổng cục Thuế có công văn 1439 gởi cục thuế các tỉnh, thành xử lý triệt để các vi phạm này.
Công văn nêu rõ, để ngăn chặn hành vi trốn thuế ngày càng phức tạp và ngăn ngừa tình trạng bán hàng không xuất hóa đơn, sử dụng hóa đơn bất hợp pháp, sử dụng bất hợp pháp hóa đơn của người nộp thuế, tổng cục yêu cầu cục thuế các tỉnh, TP tiếp tục thực hiện kiểm tra, xử lý triệt để.
Đối với hộ kinh doanh, trước đây Tổng cục Thuế đã có công văn đề nghị các cục thuế chỉ đạo chi cục thuế rà soát hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh trên địa bàn để đảm bảo đưa hết các hộ, cá nhân kinh doanh vào quản lý, chống thất thu về số hộ. Những hộ chưa có đăng ký kinh doanh, đăng ký thuế thì hướng dẫn để người nộp thuế đăng ký theo đúng quy định. Đối với hộ kinh doanh khoán thuế có sử dụng hóa đơn thực hiện theo hướng dẫn tại công văn số 4017/BTC-TCT ngày 28-3-2011 của Bộ Tài chính.
Đối với doanh nghiệp, phải tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra hóa đơn trên địa bàn để phát hiện các dấu hiệu vi phạm về tạo, quản lý, sử dụng hóa đơn theo Thông tư 153/2010/TT-BTC, đặc biệt chú trọng kiểm tra các doanh nghiệp, tổ chức, cá nhân thuộc nhóm hay vi phạm về sử dụng hóa đơn để chấn chỉnh, xử lý kịp thời như các siêu thị, nhà hàng, hệ thống bán lẻ… Việc kiểm tra hóa đơn được thực hiện theo quy trình kiểm tra hóa đơn ban hành kèm theo Quyết định số 381/QĐ-TCT ngày 31-3-2011 của Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế.
Riêng về kiểm tra hoàn thuế, thực hiện cơ chế hậu kiểm trong việc hoàn thuế, tăng cường kiểm tra hồ sơ hoàn thuế tại trụ sở người nộp thuế, đặc biệt chú trọng kiểm tra các đơn vị kinh doanh hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu để phát hiện các trường hợp kê khai, khấu trừ thuế GTGT hàng hóa, dịch vụ mua vào không đúng quy định như khấu trừ thuế GTGT đầu vào nhưng không có hóa đơn hoặc không thanh toán qua ngân hàng; kiểm tra số lượng hàng thực xuất có xác nhận của cơ quan hải quan trên tờ khai hàng hóa xuất khẩu…
Các cơ quan quản lý thuế phải tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra tại các doanh nghiệp, đặc biệt chú trọng thanh tra, kiểm tra các đơn vị có nhiều cơ sở hạch toán phụ thuộc như chi nhánh, cửa hàng… ở các địa phương khác với địa phương (tỉnh, TP trực thuộc Trung ương) nơi đơn vị có trụ sở chính để kịp thời phát hiện các hành vi bán hàng không xuất hóa đơn, hạch toán thiếu doanh thu… để xử lý hoặc kiến nghị xử lý đối với từng trường hợp vi phạm cụ thể.
Tăng cường các biện pháp để kiểm soát chặt chẽ doanh thu, chi phí của các doanh nghiệp như: áp dụng các định mức kinh tế - kỹ thuật; thực hiện kiểm tra việc bán hàng tại các doanh nghiệp đảm bảo việc bán hàng hóa phải xuất hóa đơn và kê khai nộp thuế theo quy định. Hàng hóa mua vào phải có hóa đơn và thanh toán qua ngân hàng theo quy định, trong đó tập trung vào các đơn vị có hệ thống siêu thị, hệ thống phân phối bán lẻ. Trong quá trình thực hiện, nếu có vướng mắc, cơ quan thuế phải báo các ngay với tổng cục để xử lý.